107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0836 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  328  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  85.99 
 
 		 171 aa  275  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  40.68 
 
 		 131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  35.2 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  44.58 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  32.76 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  33.04 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  30 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  38.2 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  31.67 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  31.67 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  38.2 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  35.48 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  38.2 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  36.3 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  33.94 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  37.37 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  48 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  41.67 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  32.47 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  35.14 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  32.22 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  31.37 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  36.9 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  32.47 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  25.26 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  30.11 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  38.82 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  31.91 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  29.33 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  34.29 
 
 		 386 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  40.35 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  27.71 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  34.25 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  26.73 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  35.62 
 
 		 98 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  33 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  31.25 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  28.24 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  44.62 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  32.22 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  37.93 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  29.79 
 
 		 249 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  36.07 
 
 		 130 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  41.67 
 
 		 116 aa  47.8  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  39.13 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  34.58 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  28.95 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  43.75 
 
 		 95 aa  45.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  53.49 
 
 		 97 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  26.67 
 
 		 99 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  41.38 
 
 		 97 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  26.03 
 
 		 112 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  47.5 
 
 		 75 aa  44.3  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  34.21 
 
 		 323 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  32.76 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  58.33 
 
 		 132 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5146  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  32.14 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  31.03 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  26.03 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  39.62 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  32.5 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  32.31 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  34.38 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  25.84 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  25.33 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  27.63 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  37.29 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  40.85 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  29.31 
 
 		 386 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  44.44 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  32.89 
 
 		 323 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2943  hypothetical protein  68.97 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.127866  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  28.4 
 
 		 124 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  37.93 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  34.92 
 
 		 98 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>