63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1882 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
95 aa  191  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0989  hypothetical protein  41.67 
 
 
77 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  32.47 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  52.5 
 
 
386 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  40.32 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  36.11 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  43.55 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  44.9 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  44.68 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  49.09 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  31.17 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  38.18 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  37.93 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  40.79 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  56.1 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  53.49 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  72 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  51.16 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  38.98 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  38.46 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  62.07 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  54.55 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  57.58 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  46.15 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  36.84 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  37.29 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  42.59 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  65.62 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  40.58 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  44.07 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  42.31 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  45.83 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  60 
 
 
133 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  36.84 
 
 
145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  60 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  69.23 
 
 
97 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  36.84 
 
 
145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  51.61 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  29.58 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  34.62 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  68 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  36.84 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  57.58 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  36.11 
 
 
96 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  62.07 
 
 
131 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  36.11 
 
 
96 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>