60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0597 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  316  9e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  36.78 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  36.71 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  34.72 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  32.88 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  42.42 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  32.88 
 
 
323 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  43.08 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  39.66 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  43.64 
 
 
124 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  41.79 
 
 
94 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  47.73 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  37.21 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  43.37 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  46.43 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  43.75 
 
 
91 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  34.72 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  38.1 
 
 
386 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  31.15 
 
 
127 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  40.3 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  42.19 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  34.83 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  37.8 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  35 
 
 
124 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  46.94 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  57.14 
 
 
95 aa  44.7  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  38.1 
 
 
114 aa  44.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  46.88 
 
 
99 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  39.36 
 
 
211 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  42.86 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  35.48 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  43.55 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  43.75 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  45.83 
 
 
98 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  32.14 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  41.03 
 
 
125 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  36.59 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  33.75 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  32.84 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  35.96 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  40.82 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  31.65 
 
 
97 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  46 
 
 
249 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  52.27 
 
 
75 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  41.94 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  35.21 
 
 
130 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  48.78 
 
 
126 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  42.37 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  40.32 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  34.78 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  42.62 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  35.94 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  41.46 
 
 
96 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0594  protein of unknown function DUF1232  31.11 
 
 
90 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>