53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0842 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
99 aa  199  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  50.48 
 
 
105 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  42.42 
 
 
99 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  46.08 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  40.66 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  38.95 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  38.95 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  44.21 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  34.88 
 
 
386 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  42 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  41.86 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  43.4 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  32.22 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  36.21 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  47.54 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  45.83 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  36.92 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  36.51 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  38.16 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  36.51 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  46.88 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  44.44 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  50 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  45.71 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  33.75 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  38.46 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  42.19 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  51.28 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  62.5 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  40.82 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  42.19 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  31.58 
 
 
129 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  35.19 
 
 
167 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  37.1 
 
 
153 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  29.85 
 
 
171 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  34.92 
 
 
97 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  44.44 
 
 
126 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  28.38 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  30.19 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  28.38 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  48.89 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  28.38 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  28.38 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  34.57 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  41.03 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1467  protein of unknown function DUF1232  43.14 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0495274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  40.48 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  38.1 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  40.91 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  33.82 
 
 
162 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  27.63 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>