20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3693 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  404  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  79.26 
 
 
171 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  39.53 
 
 
323 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  38.46 
 
 
323 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  35.78 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  31.52 
 
 
153 aa  61.2  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  32.26 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  40.66 
 
 
138 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  40.66 
 
 
138 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  40.66 
 
 
138 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 
145 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  37.7 
 
 
386 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3947  protein of unknown function DUF1232  38.46 
 
 
130 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  35.29 
 
 
94 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  41.51 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1535  hypothetical protein  24 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  45.24 
 
 
130 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0352  hypothetical protein  21.55 
 
 
284 aa  41.6  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00316241  normal  0.651625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>