86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3947 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3947  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 130 aa  227  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  57.98 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  57.98 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  57.98 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2458  protein of unknown function DUF1232  64.15 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  41.53 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  39.47 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  40.96 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  39.77 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  31.58 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  31.87 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  25.81 
 
 		 323 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  33 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  25.81 
 
 		 323 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  42.31 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  31.08 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  44.23 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  44.23 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  36.71 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  45.16 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  44.93 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  42.31 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  43.21 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  29.17 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  30.67 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  53.85 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  46.55 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  55.26 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  58.82 
 
 		 386 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  40.91 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  51.28 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  40.82 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  30.93 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  47.5 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  52.63 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  47.5 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  43.14 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  41.3 
 
 		 131 aa  43.9  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  52.94 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  39.24 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  39.24 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  57.58 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  42.59 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  43.18 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  42.19 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  23.86 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  38.46 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  45.65 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  39.62 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  45.65 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  45.65 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  45.65 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  33.72 
 
 		 130 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  28.12 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  41.3 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  30.19 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  40.91 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  39.62 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  39.62 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  35.85 
 
 		 105 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  59.38 
 
 		 125 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  55.17 
 
 		 133 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  40.91 
 
 		 121 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  32.56 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  53.12 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  34.43 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  59.26 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  61.29 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  41.86 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  38.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  47.22 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  61.54 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  52.78 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0893  hypothetical protein  30.23 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  53.12 
 
 		 126 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  39.39 
 
 		 129 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>