42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1633 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  293  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  33.61 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  32.29 
 
 		 323 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  32.29 
 
 		 323 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  32.32 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  25.45 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  29.17 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  32.56 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  32.56 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  32.56 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0352  hypothetical protein  28.85 
 
 		 284 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00316241  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  39.39 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2458  protein of unknown function DUF1232  32.22 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  29.73 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  28.72 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  34.18 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  51.22 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  29.35 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  39.53 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  32.93 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  32.5 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3947  protein of unknown function DUF1232  33 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  31.71 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  32.53 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  53.33 
 
 		 171 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  52.78 
 
 		 95 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  37.74 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0893  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  34.72 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  46.15 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  46.15 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  29.73 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  33.9 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 		 124 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>