25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1813 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
96 aa  196  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
96 aa  196  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  49.47 
 
 
99 aa  103  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  46.53 
 
 
105 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  52.08 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  38.95 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  46.51 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  59.68 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  34.62 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  30.86 
 
 
103 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  36.49 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  31.46 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  48.08 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  33.87 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  37.04 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  42.22 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22250  Protein of unknown function (DUF1232)  40 
 
 
98 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  29.49 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  44.64 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  36.11 
 
 
95 aa  40  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  35.82 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  35.82 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>