36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2992 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  59.57 
 
 
96 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  45.26 
 
 
99 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  44.21 
 
 
99 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  56.92 
 
 
105 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  59.68 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  59.68 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  47.73 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  35.53 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  33.8 
 
 
386 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 
152 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  28.99 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  48.78 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  27.63 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  39.22 
 
 
123 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 
120 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  30.86 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  29.76 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  26.67 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  28 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  34.33 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  25.33 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  30.36 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  38.98 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  38.98 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  38.98 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  36.62 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  38.98 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  38.98 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  31.82 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  29.11 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>