100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2908 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 152 aa  306  5e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  52.76 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  51.18 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  45.89 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  50.77 
 
 		 148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  44.36 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  40.44 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  39.84 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  40.17 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  30.6 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  28.99 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  37.23 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  29.87 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  31 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  24.03 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  25.51 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  25.49 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  26.09 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  25.9 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  28.74 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  26.44 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  32.56 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  38.83 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  38.6 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  28.46 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  22.58 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  32.47 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  48.08 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  57.78 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  30.59 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  42.31 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  41.38 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  47.92 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  45.65 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  47.92 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  29.63 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  29.09 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  47.92 
 
 		 122 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  47.92 
 
 		 122 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  39.13 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  34.29 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  34.29 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  34.38 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  38 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  42 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  38.1 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  24.17 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  51.28 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  28.26 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  21.25 
 
 		 112 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  29.11 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  36.54 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  43.59 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  47.92 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  32.88 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  32.84 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  42 
 
 		 121 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  42.5 
 
 		 135 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  41.07 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  41.07 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  41.07 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  47.22 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  41.03 
 
 		 123 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  31.71 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  45.24 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  42.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  41.03 
 
 		 386 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  40.48 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  42.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  42.31 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  37.1 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  43.59 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  37.25 
 
 		 323 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  43.18 
 
 		 121 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  43.18 
 
 		 121 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  47.22 
 
 		 119 aa  40.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>