88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0801 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  243  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  40.95 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  39.64 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  36.04 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  37.61 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  36.19 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  41 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  35.58 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  35.58 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  33.94 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  39.18 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  36.04 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  32.46 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  40.7 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  40.66 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  35.16 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  35.16 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  32.93 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  30.48 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  29.17 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  33.65 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  45.24 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  28.12 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  35.63 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  32.99 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  32 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  32.94 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  38.78 
 
 
130 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  36.73 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  31.58 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  38.71 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  31.58 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  25.66 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  38.81 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  32.35 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  30.12 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 
98 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  40.48 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  32.39 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  38.3 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 
96 aa  43.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 
96 aa  43.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  35.14 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  30.56 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  40.43 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  31 
 
 
140 aa  42  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  28.57 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  43.48 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  26.76 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  39.22 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  37.88 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  22.45 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  37.84 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  22.45 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  22.45 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  35.94 
 
 
127 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>