97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2278 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
151 aa  303  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  67.59 
 
 
155 aa  209  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  46.94 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  51.47 
 
 
150 aa  152  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  47.26 
 
 
144 aa  147  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  48.95 
 
 
148 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  45.89 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  37.78 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  29.37 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  28.69 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  28.69 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  36 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  35 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  31 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  28.42 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  28.3 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  28.3 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  28.3 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  30.19 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  34.15 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  31.17 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  28.3 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  28.09 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  26.37 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  28.32 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  29.03 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  32.47 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  24.73 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  31.4 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  30.58 
 
 
159 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  25.53 
 
 
134 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  33.72 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  26.32 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  33.72 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  31.4 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  35.48 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  28.3 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  29.73 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  36.25 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  40.98 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  31.76 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  24.27 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  52.5 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  33.7 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  43.14 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  36.54 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  38.78 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  48.78 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  21.69 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  32.26 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  32.26 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  40.48 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  48.78 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  33.82 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  48.84 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  48.84 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  48.84 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  48.84 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  34.44 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  33.9 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  37.21 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  40.54 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  30.67 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  39.62 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  46.51 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  35.29 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  28.28 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  31.03 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  29.58 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  34.38 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  29.58 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  40.43 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  35.29 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  34.55 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  31.43 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  47.06 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  41.46 
 
 
123 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  25.51 
 
 
126 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>