60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2736 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  56.34 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  48.95 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  48.55 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  50.77 
 
 		 152 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.84 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  36.51 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  29.03 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  29.03 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  35.23 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  31.73 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  37.18 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  31.65 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  35.29 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  34.12 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  35.9 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  34.12 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  35.29 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  26.73 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  31.03 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  36.59 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  40.98 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  29.89 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  30.49 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  31.4 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  28.23 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  28.71 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  27.62 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  28.05 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  47.62 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  24.59 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  47.5 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  28.23 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  40.43 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  41.38 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  34.48 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  29.76 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  45 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  20.25 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  28.92 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  36.59 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  24 
 
 		 134 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  42.5 
 
 		 126 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  43.9 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  23.91 
 
 		 96 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  34.83 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  41.46 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  42.5 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  42.5 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  30.56 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  32.81 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>