39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2752 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  44.92 
 
 		 122 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  46.59 
 
 		 112 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  45.26 
 
 		 134 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  47.37 
 
 		 118 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  36.79 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0911  hypothetical protein  48.42 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.559623  normal  0.647465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  44.59 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  44.12 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  32.61 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  36.9 
 
 		 155 aa  62  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  35.8 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  34.94 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  37.8 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  36.84 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  35.44 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  38.67 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  38.67 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  34.85 
 
 		 147 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  35.21 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  34.67 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  25 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  29.58 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  33.8 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  29.73 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  31.08 
 
 		 142 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  26.21 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  40.38 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>