66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3525 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  263  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  53.12 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  50.94 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  46.59 
 
 
185 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  40.45 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  39.64 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  40.48 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  40.48 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  35.29 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  39.24 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  35.71 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  36.9 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  34.12 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  35.14 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.53 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  36.05 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  44.3 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0911  hypothetical protein  42.05 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.559623  normal  0.647465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  38.89 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  33.72 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  35.9 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  32.91 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  38.03 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  50.85 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  29.41 
 
 
152 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  25.53 
 
 
151 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  29.21 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  24.73 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  32.14 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  26.04 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  26.6 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  30.12 
 
 
167 aa  47  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  26.85 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  35.82 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  37.93 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  28.77 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  47.83 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  52.63 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  52.63 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  33.72 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  52.63 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  24 
 
 
148 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  32.95 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  28 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>