57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0909 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 154 aa  295  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  41.13 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  32.81 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  36.29 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  38.98 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  39.34 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  38.83 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  35.11 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  30.33 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  32.73 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  38.98 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  38.98 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  41.38 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  36.25 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  37.93 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  37.93 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  35.04 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  31.52 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  33.96 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  30.39 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  30.95 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  31.96 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  26.61 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  29.08 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  32.91 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  32.63 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  35.63 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  32.98 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  40.45 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  33.75 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  33.68 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  33.68 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  46.94 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  27.38 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3992  helicase domain-containing protein  32.54 
 
 		 1154 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  48.15 
 
 		 120 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  45.95 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  45.95 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  46.94 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1506  hypothetical protein  46.81 
 
 		 124 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  39.53 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  32.43 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  54.84 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  54.84 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  42.5 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>