37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5029 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 158 aa  299  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  48.24 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  42.39 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  37.65 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  37.8 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  44.3 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  32.63 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  32 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  35.53 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  40.48 
 
 		 118 aa  50.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  30.59 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  31.63 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  25.2 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  27 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  29.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  34.55 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  33.93 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  32.31 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  38.46 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  25.21 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  39.58 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  38.6 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  38.18 
 
 		 96 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  36.84 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>