55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0853 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  34.67 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  34.74 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  36.62 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  34.62 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  36.84 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  32.91 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  35 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  32.1 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  32.93 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  34.21 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  36.84 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  30.49 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  28.43 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  30.26 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  29.73 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  32.47 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  32.63 
 
 
146 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  33.68 
 
 
146 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  33.68 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  33.68 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  32.89 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  29.79 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  35.44 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  30.59 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  34.78 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  27.85 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  30.43 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  34.55 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  27.59 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  36.07 
 
 
167 aa  42.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  27.59 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  32.47 
 
 
154 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  40.38 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  31.88 
 
 
142 aa  40.8  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  25 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  36.07 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  28 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  38.1 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  33.87 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  36.51 
 
 
130 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  39.47 
 
 
139 aa  40  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>