136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2523 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  259  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  80.99 
 
 		 124 aa  209  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  80.17 
 
 		 124 aa  209  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  79.34 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  78.51 
 
 		 142 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  77.69 
 
 		 126 aa  203  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  77.57 
 
 		 135 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  50.44 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  50.45 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  48.62 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  48.62 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  51.55 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  56.84 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  46 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  40.71 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  45.54 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  42.39 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  39.64 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  41.24 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  39.36 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  39.81 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  36.73 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  41.57 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  38.3 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  38.3 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  32.63 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  33.75 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  33.75 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  36.46 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  38.18 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  37.23 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  34.67 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  29.25 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  34.67 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  40.54 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  41.46 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  33.98 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  31.63 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  30.93 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  30.48 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  35.21 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  42.11 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  27.55 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  32.53 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  30.19 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  27.55 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  34.52 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  27.55 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  27.55 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  34.52 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  34.52 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  29.9 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  27.55 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  30.95 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  27.55 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  28.85 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  27.55 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  27.55 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  36.51 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  34.21 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  45.45 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  34.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 217 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  29.23 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 217 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  32.47 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  36.21 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  34.33 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  39.47 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  26.17 
 
 		 386 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  33.71 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  29.03 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  30.12 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  51.28 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  32.93 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>