47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1268 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  50.97 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  47.17 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  46.92 
 
 		 217 aa  205  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  46.7 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  46.7 
 
 		 217 aa  204  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  48.37 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  47.17 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  46.7 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  46.7 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2192  transcriptional regulator, XRE family  38.61 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.426149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1805  XRE family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  30.43 
 
 		 124 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  29.76 
 
 		 142 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  28.09 
 
 		 127 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  28.09 
 
 		 127 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  38.24 
 
 		 140 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  28.09 
 
 		 126 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  27.38 
 
 		 129 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 272 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0863  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 130 aa  45.8  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 134 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0635  transcriptional regulator, XRE family  22.92 
 
 		 121 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  45.1  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0910  helix-turn-helix domain protein  27.12 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 131 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  28.24 
 
 		 124 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.64 
 
 		 383 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  46.88 
 
 		 145 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  34.29 
 
 		 132 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 823 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 198 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5603  transcriptional regulator-related protein  42.31 
 
 		 88 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0365421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  29.51 
 
 		 139 aa  41.6  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>