42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2192 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2192  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
218 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.426149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  41.55 
 
 
217 aa  161  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  40.49 
 
 
217 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  40.69 
 
 
217 aa  151  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  40.2 
 
 
217 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  40.2 
 
 
217 aa  147  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  40.72 
 
 
217 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  40.72 
 
 
217 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  40.72 
 
 
217 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  40.41 
 
 
217 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  40.21 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  40.21 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  38.22 
 
 
213 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1805  XRE family transcriptional regulator  30.33 
 
 
224 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
460 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
194 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2499  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500321  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 
145 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5087  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  27.12 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
285 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  29.66 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  35.62 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  40.68 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  37.5 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0098  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.36 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  34.48 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  37.5 
 
 
237 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  32.79 
 
 
121 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  32.79 
 
 
121 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  24.75 
 
 
139 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  40.68 
 
 
186 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  35.09 
 
 
180 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 
201 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>