81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0116 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  39.23 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  37.78 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  38.4 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  37.69 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  36.72 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  36.67 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  32.26 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  36.51 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  38.68 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  38.68 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  29 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  34.67 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  46.55 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  37.38 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  30.16 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  33.94 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  32.08 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  33.02 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  37.38 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  36.45 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  36.45 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  31.11 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  31.71 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  43.01 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  39.39 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  33.65 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  31.37 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  43.4 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  40.3 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  42.11 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  37.88 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  31.58 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  33.88 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  40.32 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  32.76 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  28.87 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  43.48 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  35.59 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  37.93 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  40.82 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  42.53 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  38.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0352  hypothetical protein  29.89 
 
 		 284 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00316241  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  43.48 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  33.8 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  42.53 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  31.25 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  28.77 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  36.92 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  36.92 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  31.25 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  35 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  38.46 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  31.25 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  27.16 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  48.39 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  38 
 
 		 121 aa  42  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 217 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  23.68 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  51.06 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  34.92 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  47.22 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  35.56 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>