131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4460 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 138 aa  276  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  47.65 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  38.4 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  28.69 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  40.17 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  84.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  27.5 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  40.38 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  37.66 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  29.92 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  33.01 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  37.8 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  39.53 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  39.53 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  39.53 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  39.02 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  29.03 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  39.53 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  32.95 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  38.71 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  32.95 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  29.66 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  37.18 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  33.78 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  32.05 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  34.74 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  39.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  36.71 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  46.43 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  30.99 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  33.77 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  32.63 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  34.72 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  31.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  43.21 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  56.76 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  35.48 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  37.35 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  29.29 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  34.43 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  30.85 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  23.86 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  39.33 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  39.33 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  33.9 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  43.08 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  32.2 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  60.53 
 
 		 386 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  51.06 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  46.51 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  38.3 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  47.17 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  29.03 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  43.9 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  39.66 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  32.81 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  29.03 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  39.66 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  44.68 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  30.26 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  48.57 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  35.8 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  39.66 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  46.34 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  36.25 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  47.62 
 
 		 122 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  47.62 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  47.62 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  47.62 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  41.51 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  28.41 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  42.5 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  42.55 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  41.51 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  37.29 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>