103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01225 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  281  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  39.52 
 
 
131 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  37.38 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  38.32 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  35.83 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  34.62 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  32.95 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  36.49 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  30.77 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  25.36 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  31.58 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  28.42 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  38.36 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.26 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  37.84 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  24.03 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  30.34 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  35.9 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  37.8 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  46.81 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  37.84 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  36.49 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  37.84 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  32.43 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  48.89 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  36.73 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  40.82 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  33.78 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  35.14 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  46.81 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  29.57 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  37.1 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  35.48 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  35.48 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  35.14 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  45.65 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  37.1 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  43.18 
 
 
386 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  30.58 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  40.82 
 
 
125 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  45.45 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  42.22 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  35.14 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  40.82 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  29.73 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  28.71 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  34.69 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  48.89 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  40.82 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  39.39 
 
 
323 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  44.9 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  26.58 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  40.91 
 
 
386 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  40.82 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  26.85 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  33.78 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  36.73 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  40.91 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  46.51 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  27.4 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  62.07 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  45.83 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  62.07 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  51.72 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  47.73 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  51.72 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  51.43 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  44.19 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  31.58 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  47.62 
 
 
99 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  33.93 
 
 
249 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  35.71 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  40.48 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  35.56 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  29.82 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  35.94 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  45 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  35.29 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  53.57 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  27.4 
 
 
124 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>