84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1977 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  246  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  54.74 
 
 		 386 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  47.12 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  61.17 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  48.11 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  48.72 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  53.64 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  45.53 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  50.88 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  44.33 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  56.44 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  45.54 
 
 		 386 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  41.13 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  43.33 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  42.73 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  39.13 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  45.22 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  39.25 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  36.84 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  47.46 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  48.84 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  32.67 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  44.83 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  48 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  39.62 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  36.44 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  68 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  33.64 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  28.8 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  32.77 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  48.89 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  48.33 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  62.5 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  49.54 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  41.18 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  66.1 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  44.44 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  45.28 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  49.02 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  38.27 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  35 
 
 		 171 aa  52  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  44.64 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  40.32 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  41.38 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  42.19 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  32.35 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  48.28 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  31.67 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  46.55 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  33.77 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  36.73 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  36.92 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  42.59 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  39.29 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  42 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  43.1 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  27.47 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  43.1 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  38.18 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  46.55 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  27.54 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  39.66 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  30.56 
 
 		 182 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  40.43 
 
 		 249 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  31.17 
 
 		 142 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  41.51 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  32.14 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  34.15 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  31.17 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  35.38 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  35.38 
 
 		 116 aa  40  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  56.67 
 
 		 151 aa  40  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>