22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1038 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  332  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  65.24 
 
 
211 aa  209  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  36.05 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  36.05 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  37.76 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  33.68 
 
 
249 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  39.56 
 
 
138 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  39.56 
 
 
138 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  39.56 
 
 
138 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  31.4 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  32.32 
 
 
148 aa  51.2  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  30.68 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  43.37 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  42.42 
 
 
130 aa  47.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  37.7 
 
 
386 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3947  protein of unknown function DUF1232  40.96 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  38.78 
 
 
94 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  45.45 
 
 
137 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  31.37 
 
 
85 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  36.76 
 
 
75 aa  41.2  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  48.72 
 
 
126 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  34.43 
 
 
114 aa  40.8  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>