31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2259 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  314  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  55.07 
 
 
145 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  31.47 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  27.34 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  25.9 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0352  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00316241  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0893  hypothetical protein  27.64 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  31.52 
 
 
211 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1536  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.902005  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  30.59 
 
 
171 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1373  protein of unknown function DUF1232  25.19 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0385279  normal  0.458921 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  36.71 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  25.45 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  27.72 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  27.72 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  27.72 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1535  hypothetical protein  25.74 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  38.33 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  37.04 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  38.33 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  33.72 
 
 
135 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  38.75 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  38.75 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  45.61 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  36.25 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  32.43 
 
 
217 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  33.78 
 
 
217 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  33.78 
 
 
217 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  30.56 
 
 
249 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>