126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4049 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  234  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  99.13 
 
 
116 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  99.13 
 
 
116 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  98.26 
 
 
117 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  89.57 
 
 
116 aa  215  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  87.07 
 
 
116 aa  213  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  87.07 
 
 
116 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  89.66 
 
 
116 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  87.07 
 
 
116 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  71.3 
 
 
115 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  70.87 
 
 
117 aa  151  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  72.12 
 
 
119 aa  150  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  70.19 
 
 
114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  69.81 
 
 
115 aa  139  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  50.93 
 
 
126 aa  121  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  53.33 
 
 
132 aa  121  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  52.83 
 
 
134 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  52.83 
 
 
121 aa  120  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  52.83 
 
 
121 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  51.89 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  51.89 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  51.89 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  51.89 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  52.88 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  51.89 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  52.38 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  52.38 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  50.48 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  45.79 
 
 
112 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  40.59 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  35.24 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  43.53 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  43.53 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  39.36 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  42.35 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  40.48 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  36.63 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  36.63 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  38.71 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  39.18 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  37.14 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  37.14 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  34.29 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  34.82 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  39.08 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  36.56 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  41.98 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  36.67 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  37.65 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  39.08 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  39.08 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  39.08 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  34.29 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  41.67 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  41.33 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  31.43 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  31.18 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  30.3 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  29.29 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  29.29 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  41.38 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  32.1 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  32.35 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  25.96 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  35.37 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  32.22 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  32.31 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  27.84 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  30.77 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  33.73 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  38.89 
 
 
97 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  37.31 
 
 
386 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  32.76 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  33.02 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  37.29 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  26.26 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  44.44 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  44.07 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  31.94 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  32.84 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  32.35 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.35 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  30.23 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  30 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  47.5 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  30.43 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  34.69 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  33.82 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  37.65 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>