14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0426 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0426  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  64.58 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  56.41 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  47.83 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  48.84 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  41.46 
 
 		 386 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  48.84 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  40.43 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  51.28 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  38.1 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  51.22 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  48.84 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  40.43 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  41.86 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>