More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0661 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  99.59 
 
 		 257 aa  497  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  89.74 
 
 		 234 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  63.39 
 
 		 235 aa  295  6e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  61.82 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  61.82 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  61.36 
 
 		 239 aa  271  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  60 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  56.49 
 
 		 238 aa  258  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  48.17 
 
 		 226 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  48.02 
 
 		 271 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  47.96 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  48.86 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  46.98 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  46.43 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  46.7 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  46.67 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  46.7 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  48.85 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  45.87 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  47.32 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  44 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  44.49 
 
 		 236 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  47.79 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  46.83 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  46.83 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  47.91 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  45.62 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  44.29 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  44.89 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  45.89 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  44.54 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  43.36 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  44.71 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  43.28 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  46.15 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  39.42 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  45.03 
 
 		 226 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  41.79 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  39.72 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  44.98 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  39.45 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  37.98 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  37.9 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  42.51 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1737  ribonuclease III  47.49 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  38.03 
 
 		 222 aa  142  7e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  38.42 
 
 		 228 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  38.22 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  39.07 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  39.07 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  38.29 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  37.99 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  39.62 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  43.5 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  40.09 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  35.45 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  38.86 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  40.47 
 
 		 226 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  37.56 
 
 		 227 aa  129  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  39.15 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  38.1 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  37.96 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  37.96 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  37.29 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  37.38 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  37.61 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  38.39 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  36.04 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  39.9 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  36.94 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  37.5 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.96 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  38.43 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  36.45 
 
 		 300 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  39.34 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  40.09 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  36.02 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  36.2 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  37.56 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  41.4 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  41.4 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35.89 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  39.53 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.1 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  37.04 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  35.59 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  36.49 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  37.26 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  37.26 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  37.26 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0650  ribonuclease III  39.6 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  34.08 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.11 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  34.04 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  36.97 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  40.28 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  36.36 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  35.75 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  36.97 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>