More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2232 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  93.36 
 
 		 256 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  93.75 
 
 		 256 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  72.69 
 
 		 259 aa  343  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  65.65 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  63.4 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  51.98 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  49.19 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  49.79 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  50.65 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  50 
 
 		 272 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  52.23 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  50.23 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  51.93 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  48.18 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  47.3 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  46.98 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  46.98 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  46.93 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  47.35 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  47.7 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  48.65 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  46.85 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  49.29 
 
 		 229 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  49.29 
 
 		 229 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  49.76 
 
 		 229 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  46.15 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  45.7 
 
 		 239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  46.19 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  50.99 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  47.25 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  43.23 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  42.79 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  45.91 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  44.75 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  43.52 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  45.81 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  42.01 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2975  ribonuclease III  46.3 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00170504  hitchhiker  0.00754361 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  41.55 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  47 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  38.96 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  40.99 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  42.59 
 
 		 229 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  43.46 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.35 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  46.8 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  40.54 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  42.38 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  42.33 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  43.06 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  38.94 
 
 		 266 aa  154  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  39.04 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  43.4 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  43.84 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  39.01 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  39.29 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  40.54 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  41.59 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  41.59 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  42.86 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  45.45 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  41.26 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  41.12 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  41.94 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  42.4 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  45.73 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  40.18 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  43.27 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  43.27 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  41.44 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  40.95 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  43.78 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  41.63 
 
 		 226 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  41.44 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  43.81 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  44.02 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  41.74 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  41.52 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  40.27 
 
 		 230 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  41.86 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  39.27 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  38.18 
 
 		 228 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  40.34 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  39.04 
 
 		 226 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  40.91 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  41.59 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  41.43 
 
 		 233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  41.87 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  41.87 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  40.79 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.81 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  38.22 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  38.22 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  38.22 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  37.78 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.67 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  38.22 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.84 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  40.54 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>