More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3881 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  56.17 
 
 		 235 aa  264  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  58.06 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  56.56 
 
 		 271 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  56.82 
 
 		 271 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  57.27 
 
 		 272 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  57.6 
 
 		 368 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  56.14 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  57.85 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  57.85 
 
 		 266 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  53.12 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  52.68 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  52.16 
 
 		 256 aa  215  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  51.57 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  48.68 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  48.68 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  46.02 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  46.02 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  44.74 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  45.25 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  45.81 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  46.64 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  46.54 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  43.24 
 
 		 228 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  46.54 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  46.05 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  46.61 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  45.5 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  40.28 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  40.79 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  42.15 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  40.79 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  44.44 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  42.49 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.7 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  43.27 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  43.19 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  41.01 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  39.37 
 
 		 263 aa  154  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  38.97 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  38.97 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  40.99 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  40.99 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  36.2 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  37.78 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  42.93 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  38.1 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  37.56 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  42.52 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  38.86 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  40.18 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  35.87 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  40.18 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  42.5 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  40.18 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  40.09 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.85 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  37.39 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  36.89 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  37.39 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  40.18 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  35.87 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  39.01 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  37.39 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  40.2 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  38.81 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  38.78 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  37.79 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  35.91 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  36.99 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  44.87 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  43.36 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  40.4 
 
 		 428 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  38.12 
 
 		 266 aa  141  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  39.39 
 
 		 441 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  39.9 
 
 		 406 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2899  ribonuclease III  39.9 
 
 		 418 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.560315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  39.9 
 
 		 408 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  36.49 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  39.9 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  37.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  37.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  39.9 
 
 		 467 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  37.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  37.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  39.9 
 
 		 467 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  39.9 
 
 		 467 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  39.9 
 
 		 467 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  37.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  37.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  37.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  37.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  39.9 
 
 		 467 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  40.17 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>