More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0373 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  100 
 
 		 249 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  60.79 
 
 		 221 aa  244  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  44.74 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  45.98 
 
 		 221 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  43.42 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  42.24 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  43.11 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  41.33 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  43.11 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  44.16 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  42.53 
 
 		 229 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  37 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  43.64 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  47.06 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  42.42 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  39.83 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  40.83 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  37.77 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  40.37 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  40.43 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  39.33 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  41.26 
 
 		 229 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  41.26 
 
 		 229 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  37.34 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  32.77 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  40.43 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  34.73 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  40 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  41.99 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  40.87 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  38.79 
 
 		 228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  40.55 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  39.91 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  41.56 
 
 		 256 aa  144  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  36.25 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  41.13 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  38.63 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  37.83 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  40.26 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  36.8 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  41.3 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  38.1 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  37.34 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  38.43 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  38.56 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  38.72 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  37.83 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  39.02 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  37.66 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  38.05 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  38.56 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  40 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  37.66 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  41.03 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  40.19 
 
 		 226 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  38.53 
 
 		 225 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  38.61 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  37.23 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  37.23 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  34.58 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  37.5 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  38.86 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  38.33 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  35.62 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  42.31 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  40 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  40 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  36.91 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  39.17 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  42.92 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  41.59 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  37.08 
 
 		 227 aa  135  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  36.8 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  37.23 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  35.22 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  38.46 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  46.54 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.4 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  36.68 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  35.89 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  35.62 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  36.8 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  36.8 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  36.8 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  35.83 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  35.53 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  37.61 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  38.86 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  39.83 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  42.99 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  36.52 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  32.91 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  37.38 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  33.92 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  34.84 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.28 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  35.65 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  36.09 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1947  ribonuclease III  39.61 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  38.26 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>