More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1240 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  53.39 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  53.39 
 
 		 226 aa  239  4e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  43.11 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  43.44 
 
 		 222 aa  182  6e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  40.53 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  37.72 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  36.52 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  37.99 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  37.61 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  39.35 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  40 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  40.09 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  38.81 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  38.18 
 
 		 272 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  39.82 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  38.89 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  39.29 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  38.7 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  39.35 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  36.44 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  36.73 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  39.45 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  38.67 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  35.59 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  36.61 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  39.65 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  38.77 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  39.72 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  39.19 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  36.61 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  39.72 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  35.24 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  38.38 
 
 		 249 aa  148  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  39.65 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  37.84 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  35.37 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  38.79 
 
 		 223 aa  148  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  37.44 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  36.73 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  40.27 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  38.35 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  39.21 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  39.21 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  39.21 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  36.73 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  36.96 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  40 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  38.01 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  34.93 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.77 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  36.73 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  38.77 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  38.77 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  38.77 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  39.49 
 
 		 266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.35 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  36.49 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  38.33 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  36.16 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  34.42 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  38.53 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  37.89 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  38.14 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  35.19 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  35 
 
 		 281 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  38.43 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  38.03 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.94 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.46 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  35.4 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  35.5 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  35.06 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  35.53 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  36.28 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  35.51 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  34.82 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35.02 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  35.38 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  40 
 
 		 223 aa  142  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  34.84 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  36.04 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  36.99 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1204  ribonuclease III  35.51 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.401784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  40.1 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  35.09 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3071  ribonuclease III  35.05 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  37.27 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  36.41 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  33.33 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  35.96 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  34.36 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  34.76 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  34.62 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  34.36 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  35.91 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  35.19 
 
 		 256 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  35.19 
 
 		 256 aa  138  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  35.1 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>