More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1742 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  63.35 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  64.09 
 
 		 226 aa  277  7e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  61.93 
 
 		 222 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  61.09 
 
 		 224 aa  268  5e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  60.63 
 
 		 225 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  60.63 
 
 		 225 aa  266  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  59.45 
 
 		 227 aa  259  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  62.5 
 
 		 223 aa  258  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  47.25 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  44.95 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  46.05 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.04 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  42.11 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  44.8 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  42.67 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  42.99 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  41.55 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  41.15 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  41.78 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  39.73 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  40.36 
 
 		 246 aa  175  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  40.81 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  42.72 
 
 		 282 aa  174  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.41 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  40 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  41.74 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.65 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  40.72 
 
 		 377 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  41.1 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  43.06 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  41.47 
 
 		 383 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  39.21 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  40.38 
 
 		 246 aa  167  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  41.47 
 
 		 383 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  40.55 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  41.47 
 
 		 385 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  43.98 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  40.81 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  42.93 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  43.13 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  43.6 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  41.15 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  39.27 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  43.13 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  42.25 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  45.5 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  39.72 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  40.74 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.73 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  40 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  42.18 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  41.82 
 
 		 242 aa  161  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  39.04 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  41.26 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.96 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  42.79 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  37.5 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  44.55 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  38.36 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  41.36 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  41.36 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  42.5 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  37.39 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  40.28 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  39.21 
 
 		 239 aa  158  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  39.81 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  39.37 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  42.45 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  42.06 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  38.79 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  40.17 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  37.44 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  40.27 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  40.19 
 
 		 263 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  41.31 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  38.91 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  38.05 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  41.71 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  37.27 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  40.57 
 
 		 260 aa  154  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  35.91 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  38.64 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  37.96 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  38.03 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  39.51 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  40.48 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  40 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  40 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  39.51 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.27 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  40.93 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  41.1 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  38.14 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  38.36 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  40.1 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  38.25 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  37.73 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>