More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1613 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  100 
 
 		 223 aa  443  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  62.56 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  58.99 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  60.19 
 
 		 223 aa  258  6e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  59.72 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  59.26 
 
 		 222 aa  251  7e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  59.26 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  59.26 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  57.48 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  46.45 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  46.51 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  44.86 
 
 		 259 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  45 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  46.46 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  44.65 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.11 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  44.2 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.89 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  42.99 
 
 		 377 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  41.74 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  43.78 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.01 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  42.67 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  43.24 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  42.66 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.91 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  44.55 
 
 		 385 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  43.6 
 
 		 383 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  43.6 
 
 		 383 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  45.25 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  41.82 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.71 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  40.45 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  42.72 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  39.83 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.99 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  40.91 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  39.73 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  43.64 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  38.57 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  41.98 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.58 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.73 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  40.34 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  42.73 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  40.72 
 
 		 245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  41.36 
 
 		 236 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  39.45 
 
 		 241 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  39.45 
 
 		 241 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  43.11 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  41.9 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  40.76 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  42.11 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  41.15 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  46.08 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.64 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  38.46 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  43.33 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  41.31 
 
 		 263 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  37.44 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  41.01 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.84 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  42.01 
 
 		 246 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  41.71 
 
 		 249 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  37.84 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  41.18 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.89 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  39.17 
 
 		 252 aa  157  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  42.22 
 
 		 240 aa  157  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  42.79 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  42.4 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  41.78 
 
 		 239 aa  157  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  42.02 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.72 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  40.93 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  42.79 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  40.93 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  40.47 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  39.91 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.57 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  39.81 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  34.38 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  42.18 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  40.19 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  39.63 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  41.15 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  40.27 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  42.01 
 
 		 234 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  38.22 
 
 		 234 aa  154  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  39.73 
 
 		 229 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  41.31 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  35.58 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  40.19 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  42.27 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  39.72 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  38.97 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  38.26 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  42.59 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  41.18 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>