More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0661 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  100 
 
 
221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  47.06 
 
 
235 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  43.95 
 
 
232 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  45.74 
 
 
236 aa  191  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  45.33 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  43.56 
 
 
246 aa  187  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  42.6 
 
 
246 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  43.61 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  42.99 
 
 
223 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  43.12 
 
 
235 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  45.54 
 
 
236 aa  178  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  44.49 
 
 
226 aa  177  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  43.46 
 
 
230 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  47.17 
 
 
246 aa  176  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  44.29 
 
 
240 aa  175  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  45.24 
 
 
233 aa  175  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  41.9 
 
 
229 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  41.9 
 
 
229 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.04 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  44.95 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  39.29 
 
 
246 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  40.36 
 
 
237 aa  171  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  46.63 
 
 
246 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  44.29 
 
 
240 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  42.11 
 
 
222 aa  169  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  41.89 
 
 
231 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  45.97 
 
 
235 aa  168  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  42.27 
 
 
224 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  43.12 
 
 
236 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  41.9 
 
 
223 aa  167  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  39.73 
 
 
246 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.74 
 
 
231 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.52 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  41.82 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  42.99 
 
 
245 aa  165  4e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  40.95 
 
 
229 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  39.19 
 
 
223 aa  165  5e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  41.82 
 
 
225 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.89 
 
 
246 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  40 
 
 
230 aa  164  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  39.63 
 
 
229 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  39.63 
 
 
229 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  39.15 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  37.39 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.52 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  39.17 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  40.36 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  41.7 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  43.06 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  39.52 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  42.34 
 
 
225 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  38.57 
 
 
222 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  39.46 
 
 
242 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.74 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  40.18 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  41.36 
 
 
225 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.59 
 
 
259 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  41.36 
 
 
225 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  42.34 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  42.34 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  42.34 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  42.67 
 
 
229 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  41.52 
 
 
225 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  41.07 
 
 
226 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  42.34 
 
 
226 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  41.15 
 
 
282 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.01 
 
 
230 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  39.63 
 
 
243 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  40.09 
 
 
229 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  40.09 
 
 
229 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.35 
 
 
240 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  43.6 
 
 
238 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  41.74 
 
 
266 aa  158  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  40.99 
 
 
226 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  38.74 
 
 
377 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  39.91 
 
 
226 aa  158  7e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  41.15 
 
 
239 aa  158  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  40.27 
 
 
227 aa  157  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  41.44 
 
 
226 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.57 
 
 
248 aa  157  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  36.53 
 
 
234 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  41.44 
 
 
226 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  38.1 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  42.18 
 
 
252 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  41.89 
 
 
245 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  38.05 
 
 
222 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  40.99 
 
 
226 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  39.35 
 
 
256 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  40.55 
 
 
234 aa  156  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  39.64 
 
 
260 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  42.38 
 
 
240 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  40.49 
 
 
227 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  41.35 
 
 
246 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  42.01 
 
 
263 aa  155  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  41.26 
 
 
256 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.54 
 
 
226 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  38.79 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  39.73 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  38.79 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  37.67 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>