More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1494 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  69.68 
 
 		 224 aa  310  1e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  68.78 
 
 		 225 aa  307  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  68.78 
 
 		 225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  65.45 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  61.36 
 
 		 227 aa  284  9e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  60.55 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  61.93 
 
 		 223 aa  271  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  59.13 
 
 		 223 aa  241  7e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  42.92 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.61 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  44.89 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.69 
 
 		 259 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  42.27 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.04 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.59 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.1 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  40.09 
 
 		 377 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  41.26 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  42.11 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  42.15 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  40.18 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  41.78 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  37.78 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  39.81 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  40.76 
 
 		 383 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  40.54 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  40.76 
 
 		 383 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  36.68 
 
 		 237 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  40.28 
 
 		 385 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  41.96 
 
 		 236 aa  164  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.04 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  38.39 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  40.97 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.13 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  38.57 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.46 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  40.18 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  42.63 
 
 		 406 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  44.08 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  42.11 
 
 		 408 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1730  ribonuclease III  42.11 
 
 		 469 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.22 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  39.01 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1010  ribonuclease III  42.55 
 
 		 425 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  42.11 
 
 		 467 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  42.11 
 
 		 467 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1014  ribonuclease III  42.55 
 
 		 425 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  42.11 
 
 		 467 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  42.11 
 
 		 467 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  42.11 
 
 		 467 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2895  ribonuclease III  42.11 
 
 		 467 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  42.11 
 
 		 467 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  37.5 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  42.02 
 
 		 409 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  38.39 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  37.79 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0654  ribonuclease III  42.02 
 
 		 409 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.988138  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  38.74 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  42.02 
 
 		 409 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  41.58 
 
 		 428 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  39.04 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  41.74 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.72 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  37.27 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  38.84 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  38.29 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  38.74 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  36.99 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  36 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2899  ribonuclease III  41.05 
 
 		 418 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.560315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  35.14 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  41.05 
 
 		 441 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.28 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  39.91 
 
 		 263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  41.85 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.59 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  39.11 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  42.29 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  39.04 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.24 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  36.32 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  33.92 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  40.3 
 
 		 263 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  38.07 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  41.4 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  38.12 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  39.34 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  40.93 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  38.99 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  41.43 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  36.99 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>