More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0243 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  70.4 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  69.3 
 
 		 229 aa  310  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  57.59 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  53.12 
 
 		 237 aa  237  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  53.98 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  43.4 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  42.41 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  44.39 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  40.97 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  44.95 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  47.3 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  41.52 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  43.69 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  43.38 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  37.95 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  41.78 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  41.7 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.4 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.2 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  41.7 
 
 		 224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  44 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.73 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.67 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.46 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  44.29 
 
 		 377 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  44 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  44 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  44.49 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  43.81 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  43.04 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  41.67 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  40.62 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  38.39 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  45.02 
 
 		 385 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  44.78 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  40.74 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  42.98 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  45.02 
 
 		 383 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.74 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.74 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.54 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  45.02 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  44.71 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  41.85 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  41.85 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.78 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  39.91 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  41.26 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  41.78 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  41.47 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  40.25 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  43.04 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  36.82 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  43.6 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  42.59 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  43.56 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  43.93 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  42.41 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.79 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  39.37 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  39.65 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  46.15 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.04 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  43.23 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  41.83 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.84 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  40.78 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  43.58 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  41.85 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.54 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  44.49 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  41.55 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  41.3 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  41.15 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  40.45 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  41.44 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  41.55 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  43.56 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  41.26 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  40.38 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  38.57 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  40.47 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  40.62 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  42.67 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  41.44 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  41.63 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  40.28 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  42.34 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  40.28 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.95 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>