More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1720 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  53.85 
 
 
236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  52.81 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  50.65 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  51.75 
 
 
235 aa  232  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  51.08 
 
 
259 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  51.05 
 
 
241 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  50.63 
 
 
241 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  51.34 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  47.77 
 
 
235 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  51.61 
 
 
236 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  49.55 
 
 
230 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  46.86 
 
 
246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  50.48 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  44.35 
 
 
233 aa  199  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  49.56 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  49.56 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  49.56 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  49.56 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  45.53 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  49.56 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  49.56 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  49.56 
 
 
245 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  49.12 
 
 
245 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  49.12 
 
 
245 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  47.81 
 
 
245 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  48.68 
 
 
245 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  47.66 
 
 
240 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  46.82 
 
 
231 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  47.75 
 
 
262 aa  187  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  44.49 
 
 
246 aa  187  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  45.18 
 
 
252 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.64 
 
 
377 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  45.67 
 
 
241 aa  184  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  46.4 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.28 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  47.37 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  44.04 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  47.34 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  44.76 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  43.17 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  44.09 
 
 
230 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  42.22 
 
 
228 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  42.34 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  43.69 
 
 
237 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  44.54 
 
 
224 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  44.05 
 
 
240 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  43.91 
 
 
225 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  47.49 
 
 
221 aa  180  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  43.75 
 
 
245 aa  179  4e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  42.74 
 
 
246 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  43.06 
 
 
383 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  43.06 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  44.1 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  42.13 
 
 
385 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  43.78 
 
 
240 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  42.17 
 
 
242 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  42.34 
 
 
248 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  43.6 
 
 
233 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  43.93 
 
 
240 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  48.73 
 
 
249 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  41.59 
 
 
237 aa  175  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  41.36 
 
 
246 aa  175  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  45.58 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  43.81 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  42.04 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  43.66 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  44.25 
 
 
229 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  44.21 
 
 
240 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  43.05 
 
 
227 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  43.05 
 
 
227 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  39.13 
 
 
234 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  40.99 
 
 
243 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  40.99 
 
 
243 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  47.11 
 
 
229 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  43.5 
 
 
227 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  43.93 
 
 
282 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  42.92 
 
 
229 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  43.44 
 
 
248 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  43.23 
 
 
238 aa  168  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  40.89 
 
 
223 aa  168  9e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  42.92 
 
 
225 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  41.67 
 
 
234 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  44.76 
 
 
276 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  41.74 
 
 
228 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  42.48 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  42.48 
 
 
229 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  44.73 
 
 
236 aa  165  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  42.38 
 
 
234 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  41.23 
 
 
258 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  44.05 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0659  ribonuclease III  42.18 
 
 
239 aa  164  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0117044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.4 
 
 
229 aa  164  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  42.04 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  45.18 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  46.23 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  41.94 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  40 
 
 
243 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  43.88 
 
 
276 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  42.47 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>