More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1081 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  55.46 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  56.3 
 
 		 240 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  51.54 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.35 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  41.3 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  45.45 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  43.95 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  42.6 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.24 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.34 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  37.82 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  40.18 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  41.48 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.34 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  42.15 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  41.74 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  42.73 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  41.15 
 
 		 377 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  42.22 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  40.6 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  39.74 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  41.94 
 
 		 385 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  45.19 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  39.21 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  42.04 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.15 
 
 		 221 aa  158  9e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  42.04 
 
 		 241 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  41.01 
 
 		 383 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  40 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  41.01 
 
 		 383 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  42.29 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  42.25 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  41.99 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  41.74 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  38.94 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  39.91 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  39.04 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.95 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  37.34 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  39.65 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  41.63 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  37.24 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  38.5 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  41.23 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  38.53 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  40.64 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  38.05 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  41.05 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.41 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  41.98 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  38.26 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.59 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  37.66 
 
 		 252 aa  151  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  37.08 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  41.05 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.48 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  40.61 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  39.81 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  40.74 
 
 		 223 aa  150  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  37.39 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  38.84 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.17 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  37.95 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  40.37 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  38.86 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  39.46 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.75 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  39.35 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  39.48 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  40.34 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.39 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.75 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  38.86 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  38.86 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  40.25 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  38.05 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  40.09 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  38.43 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  39.37 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  37.55 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  36.4 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  39.06 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  39.06 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  39.06 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  37.99 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.05 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  38.81 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  41.48 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  36.65 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  39.57 
 
 		 252 aa  141  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>