More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1588 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  47.14 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  47.39 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  42.67 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  41.81 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  40.95 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.1 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.29 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.42 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  37.56 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  42.92 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  45.75 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  42.86 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  40.34 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  40.43 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  42.48 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  42.36 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  38.05 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.38 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  43.75 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.79 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  42.29 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  39.57 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.61 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  40.38 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  43.36 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  38.5 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  39.38 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  41.92 
 
 		 246 aa  161  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  39.38 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  42.06 
 
 		 383 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  40.99 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  42.04 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  42.06 
 
 		 383 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  44.25 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  41.44 
 
 		 377 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.83 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  41.59 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.97 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.44 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  38.1 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  37.67 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  41.59 
 
 		 385 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  35.68 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  39.65 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  38.67 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.91 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  38.68 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  42.98 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  37 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  44.33 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  38.84 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  41.23 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  35.81 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  38.77 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  39.04 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  38.77 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  43.88 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  38.77 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  43.88 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  41.75 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  41.82 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  39.11 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  38.6 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  41.28 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  38.43 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  37.61 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  41.99 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  39.13 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  41.28 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  38.32 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  34.84 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  36.12 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  38.86 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  36.12 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  41.56 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  40.79 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  40.79 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  40.79 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  40.79 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  40.79 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  41.56 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  37.44 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  39.17 
 
 		 282 aa  148  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  38.33 
 
 		 226 aa  148  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  38.6 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  40.54 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  37.89 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.38 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  41.31 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  41.63 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  36.28 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  37 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.34 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  37 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  41.47 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  37 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  35.87 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  41.74 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  37.07 
 
 		 273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>