More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0946 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  45 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  44.25 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  42.79 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.18 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  40.89 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  43.52 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  41.59 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  41.26 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  39.22 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  39.3 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  41.07 
 
 		 246 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  41.67 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  40.36 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  42.11 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.2 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.66 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  40.36 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  39.53 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  39.17 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.63 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  42.98 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  43.6 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.44 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  40.64 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.11 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.69 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.69 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  40.64 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.59 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  41.15 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.33 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  38.4 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  39.11 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  40.74 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.91 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  38.84 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  39.34 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  39.06 
 
 		 236 aa  155  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.36 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.18 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  36.68 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  41.12 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  41.12 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  37.73 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  39.04 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  40.19 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  38.89 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  40.29 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  38.16 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  37.12 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  39.65 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  40.35 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  42.45 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  41.63 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  39.07 
 
 		 243 aa  148  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  37.91 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  38.77 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  41.26 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  40.38 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  37.67 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  38.5 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  41.48 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  37.73 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  37.44 
 
 		 377 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  42 
 
 		 223 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  37.33 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  39.73 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  41.2 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  39.81 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  40 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  38.86 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  42.06 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  37.21 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  38.43 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  37.17 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  39.17 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  39.44 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  40.97 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  36.96 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  40 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  42.52 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  42.06 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  39.63 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  38.29 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  38.46 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  40.27 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  40.72 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>