More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0918 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  45.33 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  44 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  43.44 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  42.41 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  41.94 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  41.89 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  42.25 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  42.33 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  41.33 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  41.1 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  41.44 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  42.86 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  41.4 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  39.47 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  38.76 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.82 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  41.1 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  40.17 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  39.46 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  43.24 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  39.37 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  38.77 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  37.8 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  37.8 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  40.18 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  37.56 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  41.41 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  39.35 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  40.65 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  41.59 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  41.31 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  39.91 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  37.79 
 
 		 271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  42.72 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  39.53 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  40 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.6 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  41.09 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  38.36 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  37.96 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  39.07 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  36.92 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  36.74 
 
 		 271 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  38.32 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  38.32 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  41.12 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  36.82 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  36.89 
 
 		 271 aa  141  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  37.74 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  40.65 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  36.32 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  40.1 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  37.78 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  38.29 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  38.33 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  34.82 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  34.82 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  39.56 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  40.19 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  38.46 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  39.56 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  38.36 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.48 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  42.17 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  38.43 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  35.84 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  41.35 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  39.56 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  38.05 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  39.81 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  38.03 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  38.64 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  37.61 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.64 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  39.55 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  38.43 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  39.91 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  37.86 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  35.84 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  36.74 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  37.39 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  39.29 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  39.52 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  38.91 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  38.39 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  38.22 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  37.26 
 
 		 368 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  36.56 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  36.02 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  39.91 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  38.53 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  39.52 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  41.24 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.86 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  38.18 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  39.53 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  37.79 
 
 		 281 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  36.61 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>