More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2627 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  89.74 
 
 		 245 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  89.74 
 
 		 257 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  62.34 
 
 		 235 aa  295  3e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  60.81 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  60.81 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  60.36 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  60.91 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  56.7 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  45.98 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  46.67 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  47.95 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  45.85 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  46.12 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  45 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  46.83 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  41.7 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  44.98 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  43.64 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  46.34 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  46.34 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  48.13 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  44.39 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  45.5 
 
 		 256 aa  177  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  45.5 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  43.81 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  44.4 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  45.13 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  45.62 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  47 
 
 		 272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  44.86 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  45.18 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  44.23 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  43.44 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  44.3 
 
 		 266 aa  161  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  43.72 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  44.5 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  44.98 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  38.7 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  40.3 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  38.46 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  39.91 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  37.5 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  38.53 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  37.9 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.78 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1737  ribonuclease III  46.19 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  38.74 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  39.13 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  38.92 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  38.22 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  40.09 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  37.67 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  37.67 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  37.67 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  38.57 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  38.39 
 
 		 226 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  37.09 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  36.36 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  39.9 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  35 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  36.86 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.44 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  42.5 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  38.14 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  38.14 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  37.44 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  37.44 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  37.56 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  35.45 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  38.14 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.5 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  40.28 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  38.43 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  36.24 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  40.54 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  39.07 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  35.55 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  37.95 
 
 		 233 aa  121  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.07 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  37.91 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  35.71 
 
 		 281 aa  121  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  38.21 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  38.21 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  38.21 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  40.28 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  37.5 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  38.97 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  35.51 
 
 		 300 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  39.05 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  37.91 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  37.5 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  37.91 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  37.44 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  37.39 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0650  ribonuclease III  39.11 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  35.62 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  37.67 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  35.98 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  37.44 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>