More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1737 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1737  ribonuclease III  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  52.44 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  50.9 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  49.54 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  47.35 
 
 		 256 aa  187  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  47.35 
 
 		 256 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  46.46 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  48.86 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  48 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  47.49 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  48 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  47.49 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  47.06 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  54.1 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  48.11 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  52.13 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  46.19 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  50.53 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  50.53 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  43.11 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  44.05 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  49.54 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  47.19 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  44.78 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  46.4 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  48.92 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  46.12 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  43.3 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  41.92 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  45.54 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  44.59 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  46.08 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  45.45 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  44.91 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  40.62 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  42.72 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  42.01 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  43.12 
 
 		 368 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  45.12 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  44.95 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.18 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  42.66 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  42.53 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  43.27 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  44.95 
 
 		 227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  43.5 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  43.5 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  43.5 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  45.73 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  42.79 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  42.86 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  43.32 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  42.86 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  40.69 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  42.73 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  42.47 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  42.73 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  43.38 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  43.04 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  36.84 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  43.04 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  40.64 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  43.6 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  40.27 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  39.91 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  43.13 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  34.98 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02461  ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  42.18 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  39.63 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  37.44 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  40.83 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  40.1 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.39 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  37.67 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  37.67 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  37.67 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  37.67 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  37.67 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  39.91 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  36.16 
 
 		 228 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3071  ribonuclease III  38.74 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  38.01 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  39.83 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2975  ribonuclease III  44.04 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00170504  hitchhiker  0.00754361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  38.29 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  38.26 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  41.67 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  38.07 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  38.29 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36.84 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  35.78 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>