More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1571 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  49.55 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  50.71 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  50 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  49.32 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  48.18 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  48.42 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  48.42 
 
 		 256 aa  198  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  46.12 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  45.66 
 
 		 271 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  45.41 
 
 		 272 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  45.25 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  49.76 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  47 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  47.53 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  46.88 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  45.87 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  45.87 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  48.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  48.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  45 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  47.96 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  47.62 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  45.16 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  44.44 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  47.03 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  45 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  44.95 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1737  ribonuclease III  52.44 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  47.34 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  45.41 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  45.74 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  45.91 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  45.91 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  45.74 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  43.24 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  43.32 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  37.72 
 
 		 232 aa  164  8e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  42.92 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  44.78 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  44.55 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  41.67 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  44.95 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  41.86 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  38.43 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.82 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  41.31 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  42.33 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  39.73 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  39.91 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  38.29 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  36.53 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  36.44 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.35 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.12 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  40.18 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  37.5 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  39.73 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  41.4 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  38.94 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  40.64 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  38.94 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  41.33 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  42.47 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.5 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  37.67 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36.89 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  38.36 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  41.67 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  40.53 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  39.45 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  38.86 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  38.74 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  40.18 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  38.22 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.91 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  42.44 
 
 		 240 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  39.82 
 
 		 377 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  38.79 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  39.73 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  36.61 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  40.83 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  40.64 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  35.27 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  39.83 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  41.43 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  38.94 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  39.82 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  41.97 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  37.02 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35.43 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  40 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2975  ribonuclease III  42.13 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00170504  hitchhiker  0.00754361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  36.73 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  40 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  41.74 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  39.45 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  36.07 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  41.88 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>