More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4602 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  76.17 
 
 		 234 aa  349  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  47.39 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  45.81 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  44.93 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  42.24 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  43.81 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  43.72 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  39.63 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  43.53 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  38.29 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.55 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.05 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  39.06 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  35.93 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  43.06 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  43.3 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  43.69 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  44.91 
 
 		 383 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  43.69 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  44.91 
 
 		 383 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.36 
 
 		 377 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  36.52 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  41.92 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  41.85 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  43.18 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  44.44 
 
 		 385 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  36.84 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  37.95 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  39.32 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  35.45 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.55 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  39.32 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  43.3 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  39.13 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.79 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.72 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  42.86 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  37.07 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  42.24 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  38.7 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  36.09 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  35.27 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  35.27 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  37.72 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.14 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  37.78 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  43.56 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.14 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  39.38 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  37.99 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  39.17 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  38.12 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  35.84 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  45.83 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  40.97 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.13 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  32.91 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  37.02 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  42.99 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  38.46 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  36.86 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  42.61 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.17 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  45.78 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  36.28 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  39.29 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  39.01 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  34.51 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  44.89 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  41.13 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  34.72 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  38.91 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  39.66 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  33.76 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  37.55 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  41.7 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  34.78 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  41.7 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  35.37 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  41.07 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  34.91 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  36.84 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  37.1 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  37.33 
 
 		 266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  40.97 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2144  RNAse III  41.26 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  33.04 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.29 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>