More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2144 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2144  RNAse III  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  58.33 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  52.84 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  52.84 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4580  ribonuclease III  50 
 
 		 227 aa  194  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3081  ribonuclease III  49.53 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.569411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  40.09 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  39.91 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  39.34 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.39 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  40.37 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  39.82 
 
 		 259 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  38.05 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  40.81 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  38.43 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  36.36 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  38.6 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.29 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.71 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.67 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  37.44 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  37.44 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.47 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36.65 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  38.05 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  40.28 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  38.46 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.91 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  36.89 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  35.24 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  37.22 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  40.27 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  41.44 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  35.43 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  34.82 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  35.27 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  34.98 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  41.44 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  36.16 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  37.91 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35.27 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  35.68 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  33.48 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  37.5 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  33.63 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  36.16 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  37.39 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.67 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  33.33 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  36.07 
 
 		 377 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  37.78 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  36.4 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  38.67 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  36.71 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  37.05 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  34.8 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  34.22 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.89 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  35.96 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  37.09 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  35.96 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  35.96 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  35.71 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  33.9 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  35.96 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  35.71 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  35.14 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  34.32 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  35.11 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  36.49 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  37.26 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  36.61 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  39.29 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  30.53 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  33.93 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  36.22 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  35.11 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  38.01 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  35.71 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  35.12 
 
 		 385 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  36.04 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  37.05 
 
 		 250 aa  118  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  35.71 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  34.21 
 
 		 241 aa  118  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  35.84 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  36.67 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  35.22 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  37.02 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  36.15 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  35.85 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>