More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  59.38 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  55.07 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  56.22 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  48.76 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  50.52 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  50.43 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  55.71 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  48.97 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  49.55 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  52.08 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  54.72 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  49.07 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  50.72 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  48.58 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  45.83 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  48.03 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  56.54 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  54.5 
 
 		 306 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  50.49 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  50 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  50 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  50 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  51.53 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  50.53 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  49.28 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  53.27 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  47.12 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  48.53 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  44.86 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  54.75 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  48.53 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  48.79 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.66 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  45.41 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  48.45 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  49 
 
 		 220 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  48.08 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  49.56 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  43.61 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  43.81 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  54.12 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.96 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  39.55 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  51.6 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  39.09 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.32 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.32 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  39.74 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  37.38 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  42.38 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  39.07 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.06 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  40.59 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  40.59 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  44.2 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.59 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  41.83 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  40.1 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  40.1 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  40.1 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  40.1 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  40.1 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  40.1 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  40.1 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  42.17 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  40.1 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  42.72 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.34 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.63 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  45.31 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  40 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.78 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  39.52 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  37.44 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.53 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  43.4 
 
 		 230 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  39.6 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  43.84 
 
 		 385 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  41.51 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  44.39 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  37.78 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  44.34 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  43.84 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  41.21 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  38.68 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  43.84 
 
 		 383 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  41.7 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.72 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  43.07 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  35.02 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  37.56 
 
 		 236 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  35.89 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  43.98 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  40.28 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  36.36 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.07 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  36.84 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  34.93 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  37.56 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>